Methoden ¶
Sequenzierung des ganzen Genoms ¶
Im vorliegenden Projekt wird das ganze Genom (Erbgut) aller beprobter Bäume sequenziert (insgesamt mindestens 2200 Individuen). Dieses Vorgehen bietet folgende Vorteile gegenüber anderen genetischen Methoden:
- Erfassung der gesamten genomischen Information eines Individuums
- Präzises Bild der heute vorhandenen genetischen Diversität
- Vertiefte Rückschlüsse auf historische Prozesse (z.B. Demographie, Genfluss)
- Charakterisierung der anpassungsrelevanten genetischen Diversität (z.B. in Bezug auf das Klima, Boden, etc.)
- Unverfälschter Vergleich zwischen Arten
- Unverfälschter Vergleich mit künftigen genetischen Erhebungen (Zeitreihe, Monitoring)
Voraussetzungen & Auswirkungen
- Referenz-Genom
- Kosten abhängig von der Genomgrösse
- Riesige Datenmengen, grosser Speicherplatzbedarf
- Grosser zeitlicher und rechnerischer Aufwand für die Analysen
Für mehr Information zu methodischen Aspekten der Untersuchung empfehlen wir Infografik 1 des Projekts GenDiB.