Methoden

Sequenzierung des ganzen Genoms

Im vorliegenden Projekt wird das ganze Genom (Erbgut) aller beprobter Bäume sequenziert (insgesamt mindestens 2200 Individuen). Dieses Vorgehen bietet folgende Vorteile gegenüber anderen genetischen Methoden:

  • Erfassung der gesamten genomischen Information eines Individuums
  • Präzises Bild der heute vorhandenen genetischen Diversität
  • Vertiefte Rückschlüsse auf historische Prozesse (z.B. Demographie, Genfluss)
  • Charakterisierung der anpassungsrelevanten genetischen Diversität (z.B. in Bezug auf das Klima, Boden, etc.)
  • Unverfälschter Vergleich zwischen Arten
  • Unverfälschter Vergleich mit künftigen genetischen Erhebungen (Zeitreihe, Monitoring)

 

Voraussetzungen & Auswirkungen

  • Referenz-Genom
  • Kosten abhängig von der Genomgrösse
  • Riesige Datenmengen, grosser Speicherplatzbedarf
  • Grosser zeitlicher und rechnerischer Aufwand für die Analysen

 

Für mehr Information zu methodischen Aspekten der Untersuchung empfehlen wir Infografik 1 des Projekts GenDiB.