Méthodes ¶
Séquençage du génome entier ¶
Dans le présent projet, l'ensemble du génome de tous les arbres échantillonnés est séquencé (au moins 2200 individus au total). Cette procédure présente les avantages suivants par rapport aux autres méthodes génétiques :
- Saisie de l'ensemble des informations génomiques d'un individu
- Image précise de la diversité génétique actuelle
- Déductions approfondies sur les processus historiques (p. ex. démographie, flux de gènes)
- Caractérisation de la diversité génétique pertinente pour l'adaptation (p. ex. en lien avec le climat, le sol, etc.)
- Comparaison non biaisée entre espèces
- Comparaison non biaisée avec de futurs relevés génétiques (série chronologique, suivi à long terme)
Conditions préalables & conséquences
- Génome de référence
- Coûts dépendant de la taille du génome
- Grande quantité de données, besoin important d'espace de stockage
- Investissement important en ressources et temps de calcul pour les analyses
Pour plus d'informations sur les aspects méthodologiques de l'étude, nous recommandons l'infographie 1 du projet GenDiB.