Indicateurs ¶
Pour décrire la diversité génétique et la structure des populations, nous calculerons les variables suivantes, à partir desquels des indicateurs correspondants pourront être dérivés :
- Diversité génétique (thêta de Watterson)
- Taille effective de la population (Ne)
- Consanguinité (Runs of homozygosity FROH)
- Diversité génétique adaptative/d'adaptation (pRDA)
- Connectivité et structure génétique (FST et PCA)
- Potentiel d'adaptation aux conditions climatiques futures (décalage génomique)
- Degré d'hybridation/introgression (admixture) chez le chêne pubescent et le tilleul
Pour plus d'informations sur la signification de ces valeurs, nous vous recommandons les infographies 1 et 2 du projet GenDiB.